[Online Winter School] Forschung mit naturwissenschaftlichen Sammlungen: Daten, Qualität und Methoden

Organisation: Gesellschaft für Biologische Daten e.V. (GFBio), Museum für Naturkunde Berlin (MfN), Deutsches Archäologisches Institut (DAI), Vernetzungs- und Kompetenzstelle Open Access Brandenburg (VuK)

Der Umgang mit Forschungsdaten wird für innovative Forschung immer wichtiger. Insbesondere objektbezogene Daten können dabei eine Herausforderung darstellen. Das WiNoDa Knowledge Lab unterstützt Forschende und Kurator*innen mit diesem fünftägigen Intensivkurs zu grundlegenden Datenkompetenzen für die Arbeit mit Objekten in der Erdsystemforschung, Archäologie und Biodiversitätsforschung.

Unsere Online Winter School bringt Expert*innen zusammen, die mit naturwissenschaftlichen Sammlungen arbeiten, und wird in Zusammenarbeit mit NFDI4Biodiversity, einem Konsortium der Nationalen Forschungsdateninfrastruktur (NFDI), organisiert.

Nehmt teil, um den gesamten Datenprozess zu erkunden – vom Verständnis verschiedener Datentypen und -standards über die Navigation in unterschiedlichen Erfassungssystemen bis hin zur Anreicherung von Datensätzen und Verbesserung der Datenqualität. Besonderes Augenmerk wird darauf gelegt, wie Sammlungsdaten FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) und offen für die wissenschaftliche Gemeinschaft zugänglich gemacht werden können.

In praktischen Übungen arbeiten die Teilnehmenden mit bestehenden Sammlungsdaten, lernen diese effizient mit SQL zu verwalten und erhalten Einblicke in die Integration und Harmonisierung von Daten über verschiedene Plattformen hinweg. Der Kurs behandelt konzeptionelle und technische Aspekte der Arbeit mit komplexen Datenstrukturen.

Die Online Winter School eignet sich sowohl für Forschende, die mit Sammlungsdaten arbeiten, als auch für Kurator*innen, die die Qualität ihrer bestehenden Datenbestände überprüfen und verbessern möchten.

Programm

Tag 1 | Montag, 24. November

• Introduction to Open Science in Object-Related Research von Philipp Kandler
• Diversity Workbench: Tools for management and curation of specimen-related data von Dagmar Triebel und Tanja Weibulat
• RDM Foundations von Caitlin Thorn

Tag 2 | Dienstag, 25. November

• OpenRefine I: Cleaning Messy Data with Ease von David Fichtmüller
• OpenRefine II: Transforming Data von Frederik Berger
• Introduction to data versioning and publication von Tobias Ortwein und Stefan Lenze
• Sharing of primary biodiversity data with the Integrated Publishing Toolkit (IPT) von Jörg Holetschek

Tag 3 | Mittwoch, 26. November 

• A hands-on Introduction to Data management and Analysis with SQL von Fabian Riebschläger
• Specify 7 (CMS) and data cleaning von David Ware
• Automatic Extraction of Structured Information from Inventory Cards von Mathias Zinnen

Tag 4 | Donnerstag, 27. November

• Galaxy Introduction von Sarah Büker
• Using CoordinateCleaner to flag recurrent errors in collection databases von Alexander Zizka und Maria Judith Carmona Higuita
• Data Visualisation with GIS von Caitlin Thorn
• 3D digitization and visualization of small objects von Michael Heethoff

Tag 5 | Freitag, 28. November

• AI‑powered text recognition and domain transfer von Margot Belot
• BioData Chat: natural language interaction with multiple scientific databases through MCP (Model Context Protocol) von Steffen Vogler

Sprache: Englisch

Credits: keine Credits

Über uns

Das WiNoDa Knowledge Lab ist ein Datenkompetenzzentrum, das Museen, Forschungseinrichtungen und Dienstleistungsanbieter im Bereich der Forschungsinfrastruktur zusammenbringt:

• GFBio – Gesellschaft für Biologische Daten e.V., unterstützt Forschende in der Biodiversitätsforschung und Ökologie mit Schulungen und Dienstleistungen für das Management von Forschungsdaten entlang des gesamten Datenlebenszyklus. Die Mitglieder bilden den initialen Kern des NFDI4Biodiversity-Konsortiums und betreiben gemeinsam mit der Universität Bremen dessen Geschäftsstelle.
• Als führendes Forschungsmuseum öffnet das Museum für Naturkunde Berlin seine wissenschaftlichen Sammlungen und forscht zu Biodiversität, Evolution und Geowissenschaften.
• Für die archäologische Forschung ist das Deutsche Archäologische Institut Teil des WiNoDa Knowledge Lab und als weltweit tätige Forschungseinrichtung besonders auf internationale Zusammenarbeit ausgerichtet.
• Die VuK unterstützt das Projekt bei der Umsetzung von Open Science und dessen Kommunikation.

Weitere Lernmöglichkeiten im Forschungsdatenmanagement (FDM)

Falls ihr euch für Datenmanagement in den Bereichen Biodiversität und Umweltwissenschaften interessiert, könnte die gemeinsam von NFDI4Bio, HeFDI und iDiv organisierte Winter School im Oktober 2025 für euch spannend sein. Mehr Informationen findet ihr hier: https://www.nfdi4biodiversity.org/de/events/seasonal-school-2025/

Foto: Kirill Tatarenkov